RNDr. Stanislav Geidl, Ph.D.

2016

• ChrgDescCalc.py – nástroj na výpočet nábojových deskriptorů

  HEJRET Václav GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Conference abstract

  Year: 2016, type: Conference abstract

• NEEMP – nástroj pro parametrizaci EEM

  RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KŘENEK Aleš PAZÚRIKOVÁ Jana GEIDL Stanislav KOČA Jaroslav

  Conference abstract

  Year: 2016, type: Conference abstract

• NEEMP: software for validation, accurate calculation and fast parameterization of EEM charges

  RAČEK Tomáš PAZÚRIKOVÁ Jana SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka GEIDL Stanislav KŘENEK Aleš FALGINELLA Francesco Luca HORSKÝ Vladimír HEJRET Václav KOČA Jaroslav

  Article in Periodical

  Journal of Cheminformatics, year: 2016, volume: 8, edition: October, DOI

• Parametrizace ekvalizace elektronegativity metodou diferenciální evoluce

  PAZÚRIKOVÁ Jana RAČEK Tomáš GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KŘENEK Aleš

  Conference abstract

  Year: 2016, type: Conference abstract

• Structural Bioinformatics Tools for Drug Design: Extraction of Biologically Relevant Information from Structural Databases

  KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PRAVDA Lukáš BERKA Karel GEIDL Stanislav SEHNAL David OTYEPKA Michal

  Monograph

  Year: 2016, edition: Vyd. 1., number of pages: 144 s.

• The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot

  PERCZEL András ATANASOV Atanas G. SKLENÁŘ Vladimír NOVÁČEK Jiří PAPOUŠKOVÁ Veronika KADEŘÁVEK Pavel ŽÍDEK Lukáš KOZLOWSKI Henryk WATLY Joanna HECEL Aleksandra KOLKOWSKA Paulina KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PRAVDA Lukáš SEHNAL David HORSKÝ Vladimír GEIDL Stanislav ENRIZ Ricardo D. MATĚJKA Pavel JENIŠTOVÁ Adéla DENDISOVÁ Marcela KOKAISLOVÁ Alžběta WEISSIG Volkmar OLSEN Mark COFFEY Aidan AJUEBOR Jude KEARY Ruth SANZ-GAITERO Marta VAN RAAIJ Mark J. MCAULIFFE Olivia WALTENBERGER Birgit MOCAN Andrei ŠMEJKAL Karel HEISS Elke H. DIEDERICH Marc MUSIOL Robert KOŠMRLJ Janez POLANSKI Jaroslaw JAMPÍLEK Josef

  Article in Periodical

  MOLECULES, year: 2016, volume: 21, edition: 10, DOI

• Využití nábojových deskriptorů v chemoinformatice

  GEIDL Stanislav HEJRET Václav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Appeared in Conference without Proceedings

  Year: 2016, type: Appeared in Conference without Proceedings

2015

• AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules

  IONESCU Crina-Maria SEHNAL David FALGINELLA Francesco Luca PANT Purbaj PRAVDA Lukáš BOUCHAL Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka GEIDL Stanislav KOČA Jaroslav

  Article in Periodical

  Journal of Cheminformatics, year: 2015, volume: 7, edition: 50, DOI

• High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications

  GEIDL Stanislav BOUCHAL Tomáš RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka HEJRET Václav KŘENEK Aleš ABAGYAN Ruben KOČA Jaroslav

  Article in Periodical

  Journal of Cheminformatics, year: 2015, volume: 7, edition: DEC, DOI

• How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pK(a) Prediction?

  GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BENDOVÁ Veronika PETRUSEK Lukáš IONESCU Crina-Maria JURKA Zdeněk ABAGYAN Ruben A. KOČA Jaroslav

  Article in Periodical

  Journal of Chemical Information and Modeling, year: 2015, volume: 55, edition: 6, DOI